データセット詳細

NCBI Gene RDF

NCBI Gene RDFは、NCBI GeneのデータをRDFに変換したものです。

データセット仕様

タグ	Gene
提供元	Third party
登録区分	Submitted
データ提供者	National Center for Biotechnology Information
作成者	千葉啓和ライフサイエンス統合データベースセンター
公開日	2022-05-25
ライセンス	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/about/policies/
バージョン	release_20230525
ダウンロード	https://rdfportal.org/download/ncbigene
SPARQLエンドポイント	https://rdfportal.org/ncbi/sparql

データセット統計

Triples: 550262723

Subjects: 57768578

Properties: 16

Objects: 160736140

Classes: 1

SPARQLクエリ例

例 1

エンドポイントで実行

# Endpoint: https://togodx.dbcls.jp/human/sparql
# Description: Get gene info

PREFIX insdc: <http://ddbj.nig.ac.jp/ontologies/nucleotide/>
PREFIX ncbio: <https://dbcls.github.io/ncbigene-rdf/ontology.ttl#>
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX dct: <http://purl.org/dc/terms/>

SELECT ?type_of_gene ?label ?gene_description
FROM <http://rdf.integbio.jp/dataset/togosite/homo_sapiens_gene_info>
WHERE {
    ?Gene a insdc:Gene ;
        ncbio:typeOfGene ?type_of_gene ;
        rdfs:label ?label .
    OPTIONAL {
        ?Gene dct:description ?gene_description .
    }
}
LIMIT 100

スキーマ図