データセット詳細

NANDO

NANDOは指定難病制度および小児慢性特定疾病制度を対象に、難病名を体系的かつ網羅的に整理した語彙集です。NANDOの各疾患は、国際的に多くのデータベースやシステムで採用されている疾患語彙集Mondo（Monarch Disease Ontology）と紐づけられており、OMIMやOrphanetといった国外の主要疾患データベースとの連携が可能です。

データセット仕様

タグ	Health/Disease Tag sequence (nucleic acid) Ontology/Terminology/Nomenclature
提供元	Original
登録区分	Submitted
データ提供者
作成者	仁宮洸太東京大学薬学系研究科，国立保健医療科学院高月照江大学共同利用機関法人情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター申在紋大学共同利用機関法人情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター山本泰智大学共同利用機関法人情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター片山俊明大学共同利用機関法人情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター桝屋啓志理化学研究所バイオリソース研究センター統合情報開発室川島秀一大学共同利用機関法人情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター荻島創一東北大学高等研究機構未来型医療創成センター菊池敦生東北大学大学院医学系研究科藤原豊史大学共同利用機関法人情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
公開日	2023-11-21
ライセンス	Attribution 4.0 International (CC BY 4.0) Database Center for Life Science
バージョン	2024-11-21
ダウンロード	https://rdfportal.org/download/nando
SPARQLエンドポイント	https://rdfportal.org/primary/sparql

データセット統計

Triples: 36931

Subjects: 2780

Properties: 15

Objects: 19742

Classes: 4

SPARQLクエリ例

例 1

エンドポイントで実行

# Retrieve a full list of Ids with Japanese and English labels.

PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX dcterms: <http://purl.org/dc/terms/>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>

SELECT (STR(?id) AS ?ID) (STR(?nameJ) AS ?Label_Ja) (STR(?nameE) AS ?Label_En)
FROM <http://nanbyodata.jp/ontology/nando>
WHERE
{
  ?s a owl:Class ;
     dcterms:identifier ?id
  OPTIONAL {
    ?s rdfs:label ?nameJ
    FILTER (lang(?nameJ) = "ja")
  }
  OPTIONAL {
    ?s rdfs:label ?nameE
    FILTER (lang(?nameE) = "en")
  }
}
ORDER BY ?id

例 2

エンドポイントで実行

# Retrieve a list of Ids whose descriptions include “糖尿” with Japanese and English labels.

PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX dcterms: <http://purl.org/dc/terms/>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>

SELECT (STR(?id) AS ?ID) (STR(?nameJ) AS ?Label_Ja) (STR(?nameE) AS ?Label_En)
FROM <http://nanbyodata.jp/ontology/nando>
WHERE
{
  ?s a owl:Class ;
     dcterms:identifier ?id  
  OPTIONAL {
    ?s rdfs:label ?nameJ
    FILTER (lang(?nameJ) = "ja") 
  }
  OPTIONAL {
    ?s rdfs:label ?nameE
    FILTER (lang(?nameE) = "en")
      }
 ?s dcterms:description ?description
 FILTER(CONTAINS(?description, "糖尿"))
}
ORDER BY ?id

スキーマ図