データセット詳細

HomoloGene RDF

HomoloGene RDF is a translation of HomoloGene data into RDF.

データセット仕様

タグ	Genome Gene Phylogeny/Classification
提供元	Third party
登録区分	Submitted
データ提供者	National Center for Biotechnology Information
作成者	Hirokazu ChibaDatabase Center for Life Science
公開日	2023-05-17
ライセンス	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/about/policies/
バージョン	release_20230517
ダウンロード	https://rdfportal.org/download/homologene
SPARQLエンドポイント	https://rdfportal.org/primary/sparql

データセット統計

Triples: 1553120

Subjects: 319471

Properties: 5

Objects: 773372

Classes: 3

SPARQLクエリ例

例 1

エンドポイントで実行

# Endpoint: https://rdfportal.org/primary/sparql
# Description: Get groups of orthologous genes

PREFIX orth: <http://purl.org/net/orth#>

SELECT ?Group ?gene
FROM <http://rdfportal.org/dataset/homologene>
WHERE {
    ?Group a orth:OrthologsCluster ;
        orth:hasHomologousMember ?gene .
    ?gene a orth:Gene .
}
LIMIT 100

スキーマ図