RDF Portalに、**Cellosaurus **のRDFデータセットを新たに追加しました。
Cellosaurusは、生物医学研究で利用される細胞株に関する包括的な知識リソースです。SIB Swiss Institute of BioinformaticsのCALIPHO groupによって開発されており、不死化細胞株、有限寿命細胞株、幹細胞株をはじめ、脊椎動物、無脊椎動物および植物に由来する幅広い細胞株を収録しています。
各細胞株には一意なCellosaurusアクセッション番号が付与され、推奨名称と別名、由来生物種、由来組織と細胞型、疾患との関連、ドナー情報、遺伝的変化、STRプロファイル、関連文献、細胞バンク、生物学データベースおよびオントロジーへの外部参照などの情報が整理されています。また、汚染や誤同定が報告されている細胞株など、細胞株を適切に利用するための重要な情報も提供されています。
RDF版では、これらの多様な情報がCellosaurusオントロジーを用いて構造化され、細胞株が既存の生物学的識別子、データベースおよびオントロジーと関連付けられています。Cellosaurus RDFをRDF Portalに追加することにより、SPARQLを用いた細胞株情報の検索や解析が可能になるとともに、疾患、遺伝子、生物種、組織、細胞型などを記述した他の生命科学RDFデータセットとの統合的な利用が容易になります。
CellosaurusのオリジナルRDFデータは、以下の公式RDFダウンロードページから入手できます。
配布されているアーカイブには、Cellosaurusオントロジー、データセットのメタデータ、SPARQLサンプルクエリ、およびTurtle形式のCellosaurusデータが含まれています。
ライセンスおよび再利用条件については、Cellosaurusの公式READMEを参照してください。