MoG+ RDF を新規データセットとして公開しました。
MoG+（Mouse Genome database with high added value） は、理化学研究所バイオリソース研究センター が提供するマウスゲノム変異データベースです。野生由来系統や古典的近交系を含む多様な実験用マウス系統について、ゲノム変異情報を提供し、マウス系統間のゲノム多型の比較解析を可能にします。
MoG+ RDF では、MoG+ に含まれるゲノム変異情報をRDFとして表現し、マウス系統ごとの変異を他のRDFデータセットと統合的に検索・解析できるようにしています。本RDFデータセットでは、変異レコード、マウス系統ごとのgenotype call、VEPまたはSnpEffに由来する変異影響注釈、およびゲノム座標の重なりに基づく変異とEnsemblマウス遺伝子との対応関係を記述しています。
本RDF化の特徴の一つは、ゲノムデータを記述するための標準的で再利用可能な語彙を利用している点です。ゲノム上の位置情報にはFALDOを用い、マウス染色体参照にはMCO（Mouse Chromosome Ontology） を用いています。MoG+ RDFの公開にあわせて、マウス染色体およびゲノムアセンブリを記述するための参照オントロジーとして、MCOもRDF Portalに登録しました。
MCOやFALDOのような標準的なオントロジーを用いることは、マウスゲノムに関するRDFデータセット間の相互運用性を高めるうえで重要です。染色体参照、ゲノム座標、変異位置を共通の語彙で表現することで、今後公開されるマウスゲノム関連RDFデータセットとのリンク、横断検索、比較解析が容易になります。
本データセットの利用にあたっては、MoG+ の Data Release Policy を参照してください：
https://molossinus.brc.riken.jp/mogplus3/about/policy
オリジナルのMoG+データファイルは以下から取得できます：
https://molossinus.brc.riken.jp/pub/